1872年3月9日福音使者偕函理牧師來到滬尾上岸，同年4月10日設立淡水教會，4月14日以台語講道開始傳教，翌年1873年2月9日得首批果子，即給嚴清華、吳寬裕、王長水、林孽、林杯等五名施洗；其中吳寬裕與本教會有側源。

　　吳寬裕(後做傳道師，亦做崙仔頂教會第一任傳道師)，與崙仔頂莊李恭為姑表親，他於1874年首先向李恭傳教。李恭心有疑難，仍與李沃二人往台北訪李春生；向他請教，他們以李春生因生意關係，常國外國人來往，定詳知外國人宗教，其實當時李春生對他們二人說：「偕牧師所傳的道理是真的，可以相信，並說，他自己亦是敬拜上帝的人。」李恭與李沃聽後很高興，不僅相信上帝而且鼓勵親堂招呼社子莊，郭川(郭四川)、郭求(郭神求)、郭助、郭廉、郭春等每禮拜日坐菜船往淡水教會去做禮拜。在當時至淡水往回要坐二個鐘頭的船，這七個人就是崙仔頂教會初代信徒。自此福福音種子播及斯地，扎根，在上帝榮光普照下萌芽，日復一日成長漸漸發展，日日興旺。

　　1878年4月13日偕牧師便在崙仔頂設教會，教會禮拜堂建築竣工是在同年47月4日，當時獻堂典禮中，剛剛於22日前，受加拿大長老會派到北部來做宣教師閩虔益牧師和閩師母(Rev. & Mrs. k. Junor）也來參加，當時的禮拜堂甚雅觀，是木造瓦蓋(俗名甲楝起)四角形，中間禮拜堂廳，雙邊是宿舍，一邊是傳道宿舍，一邊是漢文先生宿舍，前有大庭右有草蓋義塾一楝(俗稱書房)，漢文先生有李喬木，李種松(李種松後考中秀才轉任神學校漢文老師)，教會內外之子弟就學免費，拜堂右左前是竹圍，後面房屋稱密，前面竹圍外至港墘有三百步，又據偕牧師日記，同年10月13日甘為霖牧師由台南來到淡水時，曾由偕牧師等人帶領他來崙仔頂等地諸教會視察及佈教。

　　1884年8月5日中法戰爭爆發，不僅其他的教會遭遇迫害、搶勢，連崙仔頂教會的會友也不例外，但禮拜堂因教徒力守，故未遭拆?而得保全，又會友雖被窘逐，但都堅固信仰，堅信上帝。偕牧師於1888年11月11日到崙仔頂教會舉行洗禮式時，在他的日記寫著：「在崙仔頂給十四人施洗，一百人參加教會活動」可見當時崙仔頂教會教勢之一斑。

　　1898年6月颱風小姐三次接踵而至，靠近淡水河岸的崙仔頂禮拜堂倒在她們的裙下而流失。不得己重建禮拜堂在崙仔頂的莊內。是木造，比以前更小間，是1989年10月29日落成的，當時崙仔頂教會可說是崙仔頂莊，姓李與社仔莊，好郭兩大姓而構成的教會，雖然有鄰居的嘲笑及輕視，而勇敢地信奉上帝熱心往禮拜堂做禮拜，昔日的教會非常親密，信徒互相探訪，遇有信徒患病時，傳教者、長執和信徒偕去探訪，為之代禱。

　　至1913年由於信徒日增，重建禮堂不夠用，仍在崙仔頂與社仔兩莊之中，三角埔莊，建築較大的禮拜堂，稱之為三角埔教會，當時的禮拜堂，據北部中會1914年2月10日第十八屆春季例會議事摘要是：室內闊二丈，深三丈六尺，但現在的三角埔教會禮拜堂是在此後經擴建的。