一、社區形成，信徒移入

    1950年代，台南市郊小東路與光明街一帶逐漸發展，民眾移入者眾，逐漸形成新社區，其中含有幾戶信徒。1959年陳再成先生由澎湖移居此地開設餅舖，提供住家舉行家庭聚會，是東光教會最原始的聚會，後來雖多次遷移，仍是家庭型佈道所。 

二、倍加運動，北門響應

    1960年，北門教會響應倍加運動，正式在光明街開設教會，租用一間店面開始聚會，由神學生協助，其中一位是林震忠牧師，北門教會派王天來長老，同時開始野外主日學。1961年3月29日中會議長戴伯福牧師主持開設禮拜，正式命名為「東光」教會（因位處小東路、光明街一帶）。

三、教會弱小，增長緩慢

    1965年後蘇森錐長老前來幫忙，租用陳加濟先生住屋聚會，爾後由神學生輪流協助。

    1971年由陳添丁牧師義務講道並指導教會各種事工，並受派為小會議長並兼任牧會。1972年購買現址50坪土地，由美南差會補助十萬元協助本會建築原始平階教堂，1973年1月14日獻堂。當年先派畢業生葉餘香傳道赴任，正式選出委員。次年派顏信星傳道就任，1976離任，教會一直處在不穩定狀態。長執邀請母會前來關懷。

四、母會關懷，教勢漸進

    1976年中母會關心，派人整修教堂，聘請林震忠牧師前來協助，1978再增購75坪土地，信徒日漸增加，改造講台及牧師館，升格堂會。1984年林牧師離任，中會派王淑娟傳道赴任，一年後離任。1986年7月林牧師重回赴任為第一任牧師至1998年7月止。

五、尋求突破，重建異象

    1991年林牧師任中積極籌備重建，組織後援會與建堂委員會，良美企業提供支援，設計七樓，奈因付款沒把握而告暫停。爾後2001年8月蔡主結牧師封牧為第二任牧師，黃偉力牧師第三任牧師等除推動各種事工外，極力規劃重建新堂，均因經費拮据而不敢進行。

 六、新堂呈現，教勢增長

    2009年7月北門教會丁忠和牧師任本會小議長，積極關心教會一切事宜。8月8日水災教堂受創嚴重，修繕困難，重建計劃再起。2010年元月和會正式通過重建，小會聘請退休牧師洪溫柔前來協助，正式向中會內各教會募款，10月18日正式開工。2012年5月中竣工完成六樓建築。建築中借用東光活動中心聚會，信徒日增，聚會人數已達150人。

    新堂完成後，在陳瑞宇牧師的帶領下，東光教會發展社區事工，關懷永仁高中女籃隊，永仁女籃在HBL高中聯賽屢創佳績，時超傑教練與全體球員感謝東光教會的關懷與代禱。

    2016年10月，馮偉晉牧師接任，持續各項宣教事工，教會聚會人數穩定成長中。