一、古早史

新港教會原創於今成功鎮北邊約十公里處的石雨傘，於1877年由屏東（阿猴）里港教會西拉雅族人張源春所設。當年春天張源春從西部遷徒來東，在蟳廣澳（今小港）登陸，借住於石雨傘社頭目家，剛好頭目患哮喘病嚴重，幾已藥石罔效，  源春告以信靠耶穌必得醫治，便囑取水一杯，禱告後讓他喝下，竟然不藥而癒。頭目遂聽源春所勸，棄絕偶像真心信主。爾後他繼續用祈禱水醫治病人，結果有三、四十戶放棄偶像來信主，遂成立石雨傘教會，為東台灣宣教之始。

同年張源春又遷到觀音山及富里附近，也用信心的祈禱水行神蹟，又創立該兩間教會，成為平信徒傳福音的典範。早在1875年3月，宣教師李庥便曾在後山宣教訪問，30日到寶桑（今台東），一禮拜後又到成廣澳八社巡視，4月8日就曾到過蟳廣澳，並在一頭目家作露天禮拜。原來由於前清橫徵暴斂，加上漢人挾勢豪奪，原居嘉南平原的西拉雅族不得不往東山區遷移，有些部族便東遷到了後山。而這些族群更早在荷蘭時代便已有人接受福音，因此福音來台最初集體歸主的便是這些族群。李庥來到東部訪問應該與這些背景相當有關聯。

1879年9月，李庥牧師復派李豹及吳意兩傳道師到東部視察，並安慰當時陷於信仰迫害流言所苦的信徒。不料至9月底，李庥牧師卻因熱病逝於府城，東部教會頓然失去一位最為敬愛的牧長。1880年9月，教士應東部教會的要求，派出第一位傳道師胡古前往雨傘教會，並且越山兼迪階教會。胡傳道師在後山工作4個月後回到台灣府，並將當地教會情形向教士會報告，建議推派傳教士前往巡視並舉行聖禮典。

因此教士會巴克禮牧師於次年4月到蟳廣澳（石雨傘）、迪階（觀音山）、石牌（富里）等三間教會訪問，當時石雨傘教會在1877年張源春用祈禱水傳福音後即有三、四十戶信主。巴克禮牧師到石雨傘的時候適逢禮拜天，有50多人來參加禮拜，巴克禮牧師問道之後接納、施洗了21位成人和12位小孩，下午恭守聖餐，這也是東部教會有史以來第一次的聖禮典。

1885年10月初，李松傳道師隨涂為霖牧師前來本會牧會，是本會中載第二位傳道師。11月10日涂牧師一行，從安通山道越過海岸山脈前來石雨傘教會，此次涂牧師又接納五位信徒並設立兩位執事。12月7日涂牧師再次越過過海岸山脈到哈拉巴灣（今之泰源）探視由石雨傘教會搬來的七、八戶信徒，他然雖無牧者但熱心研讀聖經，也會見證道理，涂牧師在此接納五名並予以施洗。至10日大家再到石雨傘守聖餐。

1886年10月，李松傳道師一年任滿回到山前。再過一年(1887)，李松傳道師又受派與涂牧師一起來到本會牧會，然而當時滿清政府橫徵暴徵暴斂已激怒民怨（主要是平埔族）1888年6月又發生雷福海姦辱民妻事件，終於引發抗暴。當時抗暴民眾強求信徒加入行動，信徒在雨難中不知所措，旋不久，反抗滿清的怒火波及蟳廣澳，且已變成阿美族對全漢族（含漢化之西拉雅族）的敵視，沿海岸有三百多人被殺，本會信徒楊贛長老遂帶李松傳道師上山躲避。8月中，危險已過，李傳道師任期亦滿，便在10月29日回到府城，到了年底，迪階的阮為仁傳道也離任後，後山就完全沒有傳教師了。

1890年，時任長榮中學校長余饒理前來慰問經歷患難的後山三教會。1891年，1月中巴克禮牧師再到後山巡視，2月初9到了蟳廣澳教會（石雨傘），看到教會因無傳教師越見冷清。同年11月下旬，涂為霖牧師第三次到後山巡視，李松傳道師也三度前來牧會，12月14日涂牧師到了石雨傘，也見教會沒有進步頗為在意。1892年12月8日，宋忠堅牧師來後山探看教會，10日抵石雨傘禮拜堂，發現數戶信徒因病又去拜偶像背教，教會幾乎關門。1893年10月中，涂為霖牧師四訪後山，30日由石牌教會兄弟護送到石雨傘，但見石雨傘教會大為退步，陪餐者只剩六名。1901年12月巴克禮牧師三度來到後山，這次巴克禮牧師娘隨行。夫婦原想越山石雨傘但幾乎不可能，幸當時日警以其在府城助平有功，便找轎夫抬他們過山，使如將殘燈火的石雨傘信徒得到安慰。雖然十年來教會一直沒有傳師，但還是有十幾人作禮拜，巴克禮牧師認為難能可貴，隔年正月又接納五位信徒才離開石雨傘回到寶桑，然後回去府城。

1905年，巴克禮牧師四度來訪本會，看到教會日有進步，雖有稟革，但也為二位年輕人施洗。1905年11月底，廉德烈牧師到後山，從卑南走三天路程到石雨傘教會，沒想到這將消失的教會有六、七十人來作禮拜，原來新近來此的林策明傳道師，積極造就信徒，恢後信徒的信心，而且正計劃興建一座禮拜堂。這位林策明傳道師是到石雨傘教會的第三位傳道師，對照1908年4月號教會報告他當時還在石雨傘，而1910年12月宋忠堅牧師二度來後山，記載兄姊非常想念兩年前的他，可見他在任有三任之久，是本會早期史中在任最久的了。

第一任長老楊贛便在這次廉得烈到訪時受設立。楊長老共生五子，其第二子楊連福讀神學院，並回到東部教會，可惜早逝。楊長老的子孫至今天仍是新港教會最大的家族。此外廉得烈牧師也同時設立兩位執事。可惜這些珍貴史料（小會記錄）在日據困迫中被沒收而消失。

1914年3月，馬雅各二世到後山做醫療傳道，15日晚上到石兩傘，翌日大雨，但還有八十二人來就診。足見當時醫療需要求的迫切，回顧巴克禮博士所謂情有可原的背教問題，更印證當時宣教之難，並非資源較豐富、教育機會較大的西部教會所能想像。

往後數年迭有宣教師東訪，1916年宋忠堅第三次到東部巡視，該年石雨傘發生牛瘟，信徒亦受其害。1917年，東部兩次大颱風，禮拜堂及農作損失極大。1921年，林燕臣牧師來東部探訪，主要為排解歸北紛擾，時任本會傳道者即本會出身的楊連福傳道師。在東部南屬教會及信徒為信仰與生活奮戰之際，雖然宣教師多次來到東部造就訓練信徒，當時南部中會已悄悄決議將後山教會交北部培育辦理，「歸北事件」造成東部南屬教會極大的傷害，自1913年10月16日南部中會第十回秋季會議劃分堂會時，東部教會堂會已然除名。歸屬的紛擾一直到1938年堅持南部屬牧長相繼謝世後才得以解決。這事件的爭執不在於南北歸屬問題，而在於決定時未曾諮詢東部教會的意願，導致在感情上東部教會深覺被出賣。

二、逼迫下的地下教會

教會百年史有關石兩傘會的記載到了20年代後似乎已經消失。但根據新港教會慶祝三十週年紀念冊所載，其於1946年高篤行牧師來新港召集信徒禮拜之時，新港已有不少基督徒，衡諸條件這些基督徒暨非外來，最近的教會台東距離五十公里遠，以當時交通狀況少有可能是台東教會信徒。為追查真相，新港教會於1996年8月7日舉行「教會歷史研討會」除邀請教會65以上的兄姊來參加外，特別邀請教會史專家黃茂卿長老和林川明牧師共襄盛舉。雖已無史料，所幸還有遺老可以追述。在討論會中才發現石雨傘教會消失的主因。

教會自楊連福牧師過世即沒有傳道人，但這期間仍有四位囑託傳道師牧養教會，這四位傳道師雷啟清、陳元武、林有福、宋阿傳。最後一位是教會長老，據聞與陳溪圳牧師同學一年（特考），其子孫眾多，部份仍住新港，其中么子欽明即現任新港教會長老。

1937年第二次世界大戰爆發，日本人要求日亟，甚至命令教會禮拜之前要先拜「神社」。當時由宋阿傳長老負責，卻堅拒不拜，警察逮捕他不著，便找教會長老楊雙春，帶到派出所痛打到皮開肉綻。釋放回來通知兄姊今後即無法公開禮拜又不拜神社，祇好轉入地下秘密聚會。而且不幸的是教會的史料也在這次事件中被沒收，以致後來無法清楚交待前後史實。然而患難中依然堅持信仰，正是石雨傘教會能在谷火重生最寶貴的基礎。

1946年，高篤行牧師來到新港看他在此行醫的么子高端立長老，看到新港已有信徒，但禮拜天無處禮拜，就召集大家在醫館候診室作禮拜，第三階段的石雨傘教會－新港教會於焉開始。

1947年，教會已有三、四十人聚集，乃借鎮公所「中山堂」禮拜。信徒迫切希望有牧者前來餵養，高牧師遂力邀當時在彰化縣原斗教會牧會的林川明牧師東來。林牧師來到新港教會之後教勢大進，並努力向阿美族原住民傳福音，拓展平地和原住民教會多間，今天的長濱教會，東美忠仁、成功、和平等都是。林川明牧師在新港教會牧會三十年，於1977年教會慶祝於新港重新開始三十週年暨新殿獻堂（即現在的禮拜堂）後退休。如今雖已93高齡，身體仍然硬朗，還常回到新港與兄姊交通勉勵。林牧師退休後，接續由在新港長大受教育的簡安碩牧師（簡偕得牧師二公子）牧養約十年之久，並成立「得安托兒所」，為福音做育苗之工作，後於1986年轉任台南善化教會迄今。

1987年，林芳仲傳道師受派來新港接續牧養兩年。時值台灣民主運動方興未艾，林傳道師努力教導信徒以信仰態度關心台灣前途，後轉任台中東榮教會並受封牧師，1996年並與多位牧長成立「台灣省社區關懷協會」，積極推動社區事工，更落實愛台灣的信仰理念。2013年起林芳仲牧師擔任總會總幹事至今。

第三任林文章牧師於1990年到任，與牧師娘更致力社區工作，從事社區婦女事工，先後成立插花班與社區婦女合唱團，林牧師夫婦後來轉任台東馬偕院牧，仍接受教會請託，繼續這些事工，使教會和社區關係更形密切，更有機會推動福立事工。四位牧長接續的牧養，使石雨傘教會終於一掃陰霾，教會日漸蓬勃；但「後山」惡劣的條件依舊，教會事工的發展瓶頸仍然有待突破。

三、重新出發的新港教會

1995年四月，曾正智牧師由台灣教會公報社轉任本會第四任牧師。開始參與新港的希望工程。當時教會約有七十戶左右的信徒，因人口外流，禮拜人數也約七十人，主日學及青少年事工卻成為新港教會發展的最大工場。 社區工作也是新港教會的重點事工。林文章牧師夫婦在任期間曾努力建造社區事工的基礎，帶領插花班和社區婦女合唱團，在成功鎮上備受讚譽。曾正智牧師被聘為社教工作站委員，可以更深入社區以及鎮上文化等公益事工。新港教會與社教工作站、農、漁會等社團籌辦兒童夏令營，每年都有超過一百個小朋友參加，是鎮上一大盛事。透過過省立成功商水和成功教會協助，獲得教育部補助經費，聯合主辦或協辦原住民社會教育活動－社區講座與母語教學

1996年10月中，新港教會有感於教會拓展需要，議決購下隔壁高端立長老的房舍，做為「石雨傘宣教紀念館」，以紀念石雨傘教會在此浴火重生。而且這棟房子在歷史上不但是成功鎮上第一家醫院，鮮為人知的它也是現在「新港」肇建者－日據時代新港支廳長的別墅。它可俯瞰港區，據說該廳長年老最喜愛在陽台上欣賞他所建的漁港，熱愛台灣並葬於此

四、宣教人才的輸出港 「一領一‧新倍加」特色教會

2009年，劉炳熹牧師於神學院畢業後受派到新港教會，以信心的眼睛，開始鼓勵信徒發揮上帝所賜的創造力，勇於想像，用上帝的恩典重新定義世俗眼中之「資源」。2011年開始推動「Sinkang Mission」，悄悄地為新港人帶來新樂章與新活力；而教會也在短短的四年間，聚會人數從50幾人增加到65人，信徒競相走告，見證上帝恩典的足跡。

2012年8月27日，新港教會澳門短宣隊終於成行了，一行10人中有7個人是學生，憑著對上帝的信、對人的愛、對土地的情與一股傻勁，踏出了為期7天的「澳妙之旅」。

2013年10月6日新港教會舉行差派禮拜，差派第一階段先出發的高哲誠，預定停留三個月至明年初回台。第二階段的三個月將於農曆年後出發，差派另一位青年王瑀立。兩人除參與主日事奉，還協助開拓家庭小組，並前往聾人中心學習手語、參加英文聖經班、參與聾人團契等，在友誼陪伴中，建立關係並開拓學生事工與聾人事工。

2015年8月開始，阮以杰傳道師加入到服事團隊裡，負責兒童、青少年及社區宣教，加上長期宣教人才培訓的計畫，願上帝親自做工，教會全體會友學習彼此接納、彼此溝通，有同心合一的心志，朝著共同的使命邁進。