主後一九九二年，當台北中興教會正為教會購買禮拜堂之際，於八月中決定購買台北市敦化北路二三八巷七號一樓，。做為開拓新教會的禮拜堂。

十月一日在新禮拜堂舉行祈禱會，正式宣佈成立敦化教會，十月十一日舉行第一次主日禮拜，十月十八日下午由中會主持敦化教會開設感恩禮拜。

主後一九九三年二月十四日，舉行敦化教會昇格堂會暨首任牧師張金城牧師就任感恩禮拜。 主後二OO一年四月購買台北市敦化北路二三八巷九號一樓，做為教育中心，財產歸屬於財團法人北部台灣基督長老教會七星中會。

敦化教會重視信徒靈命培育，主日上午十時、晚上八時兩場主日禮拜，二O一五年下旬計畫每月加開一場主日下午華語禮拜，鼓勵信徒務必養成主日一定要做禮拜的生活。敦化教會致力社區宣教，成立敦化教會社區生活學苑與基督教女青年會配合從事婦女教育，成立社區活力團契與里長和社區結合推動桌球及才藝教學，重視牧長聯誼及運動，教育中心開放給牧長桌球運動與聯誼。

二O一二年十月七日舉行設教廿週年感恩禮拜，二O一三年出版設教廿週年紀念特刊，教會配合總會「一領一‧新倍加」宣教運動，讓教會更進步和增長，這是敦化教會的使命。