昔日本區稱為咖?，當時沒有教會，信徒必須步行到艋教會做禮拜。1935年在本區信徒楊鼎、陳生、陳開輝等三位弟兄熱心支時下，得艋舺教會之允許，中會乃派袁新枝牧師到東園町下庄仔作兼任的開拓教會工作，當時並有楊漳、康清塗傳道師、劉天來長老、張金波牧師、郭先琴先生等前來協助佈道，並借陳開輝伯與楊鼎叔叔的家聚會，於7月20日正式命名為東園町基督教講義所，此為雙園教會創立。之後適逢宋尚節博士來台舉行奮興佈道大會，信徒前往聽道得到激勵，此時中和庄枋寮講義所剛解散，該所信徒乃渡河前來本所聚會。1940年冬成立堂會，1942年聘石安慎牧師為首任牧師，並於1949年改名為雙園基督長老教會。

　　台灣光復後，本會信徒經戰亂分散，教會經濟日益窘困，無法支付牧師的謝禮，又石牧師老邁無法繼續牧會，以致取消堂會資格，改由中會轄。這段時間教會事工均由神學生協助，主日學、婦女會同時成立。1955年，黃玉波傳道前來牧養，並改在他的家聚會，一年半後再遷回陳生長老家，也組織青年團契。由於大家都有遷徒不便之感，乃開始籌募建堂。1958年黃傳道離開，鄭安家宣道師到任。隔年以三萬元購得第一間禮拜堂（東園街306巷），並於4月26日舉行獻堂典禮。

　　1961鄭宣道師離任，林仁和宣道師繼任，教勢日增。不料政府為了築堤坊，禮拜堂遂遭拆除，因此再以十萬元購得第二間禮拜堂（萬大路423巷10弄25號）。同年6 26日舉行獻堂典禮。1963林宣道師離任，郭鴻輝傳道到任，翌年設佳音幼稚園。1964年李伯儀宣道師到任，積極推動建堂奉獻；1969年以十萬元在埔墘買下一楝二層樓房。1970年游仁榮牧師到任，隔年二月就任，本會再度昇格為自治堂會。隔年二月就任，本會再度昇格為自治堂會。此後適逢政府推行萬大計劃，地價飛漲，於是游牧師積極著手建堂事工，信徒踴躍奉獻，加上埔墘房子處分之款，而買下第三間禮拜堂（萬大路449巷6號）。一年後因無法容納，乃於1976年賣出，並以65萬購得第四間禮拜堂，（萬大路424巷8號）。同年6月2日舉行設教四十週年暨獻堂典禮，1977年又因不敷使用，只得賣出並買下第五間禮拜堂，即萬大路424巷18-1號現在的禮拜堂

　　1984年9月游牧師離任，1985年2月汪金太牧師到任，同年6月舉行設教五十週年感恩禮拜暨第三任汪金太就任典禮。1989年6月汪牧師離任，1990年9月陳宇光牧師到任。在沒有牧師帶領的一年多歲月裡，教會眾長執及會友均同心合意服事教會，並於1990年4月買下十六號一樓的房子，?年11月4日舉行副堂的獻堂及第四任牧師陳宇光就任典禮。