1988年1月初，曾任職於台灣基督長老教會三重埔教會的長老七名：林恂、陳進旭、姚登祿、黃兆麟、黃陳愛、郭榮華、邵永裕，執事六名：林寶堂、黃正次、莊信美、黃金獅、黃恩賜等（以上十三名是重陽教會的開拓委員）；因聽見曾任三重埔教會的莊經顯牧師已在1987年12月底辭謝了台南太平境教會。三重埔市區二十幾年來隸屬於台灣長老教會的禮拜堂，只有五間，沒有新設立的教會。於是就在1988年月下旨，派林恂、黃陳愛、陳進旭、黃永裕四位長老到台南與莊牧師商量，結果莊牧師答應願意回到三重市來開拓新教會。

同時也找到了房子；即現在為牧師館兼主日學教堂的三重市過圳街42之2號的3樓，作為禮拜堂並兼牧師館（33坪，月租壹萬參仟元）。因此，向台北中會申請新設立重陽教會，得准，並隸屬於林口教會為支會。1988年2月14日下午二時，由台北中會議長楊國保牧師主禮，舉行了隆重的開設禮拜，參會者約有三百名。

重陽教會雖然離開了，然而租用於三重市過圳街42之2號的三樓是禮拜堂兼用牧師館，沒有主日學室，實在很不方便。所以莊牧師提議要購買同棟的重陽路一段113巷6號的一、二樓，共需肆佰陸拾萬元。委員會全體贊成，於主後1988年3月8日成交。同年４月１６日向中小企業銀行貸款二佰二拾萬，當時有一位愛主愛教會不具名的弟兄，願意提供二佰伍拾萬元的無息無期限借款給教會，因此完交了四佰陸拾萬元的購屋金及一切手續費。銀行貸款部份在1988年12月底已還了壹佰伍拾萬，1989年5月11日，全數還清，都是教會內許多愛主的信徒奉獻的。

特別要感謝台南太平境馬雅各紀念教會的兄姐，很踴躍的為本教會購堂奉獻。於是將二樓設為禮拜堂，一樓出租。現在預備要繼續還愛主弟兄無條件借貸給本教會的二佰伍拾萬了。

主後1989年8月7日，第三十八屆台北中會秋季會議會中，經由中會議長謝英皆長老的宣佈，昇格為堂會。

1989年11月26日，楊國保牧師、鄭秋芸長老主持牧師聘任監選事宜，出席會員47人，選舉莊經顯牧師為首任牧師。主後1990年2月18日下午2時假馬偕醫院九樓禮拜，舉行了首任牧師就任典禮，赴會者約有六百名。 

1990年10月，小會決定聘請吳文雄牧師為兼任牧師。

1996年11月3日，小會決定購買自強路一段232號6樓之新禮拜堂。1997年6月8日獻堂。

1998年6月30日，莊經顯牧師盡程退休。

1999年7月1日，孫財祥牧師就任第二任牧師。

2007年8月，柯怡政傳道師促赴任。

2008年2月3日，重陽教會設教20週年感恩禮拜。 

2010年7月，柯怡政傳道師封立牧師，就任第三任牧師。