1.艱難的開拓時期：由於三峽地方是具有共同祖籍（福建安溪人）及其血緣與祖師廟信仰崇拜的主神祖師公（陳昭應）有直系血親關係，而從事其根深蒂固的地方信仰，以至馬偕牧師自主後1876年10月5日開拓三角湧教會的初期20年間，無法安居於三峽佈道。尤其主後1883年2~3月間差點與嚴清華牧師喪命於三峽，這是馬偕牧師在北部台灣設立的第十三所教會，也是他在北部宣教史上與艋舺地方並列為最艱難設教的地方。

　　建堂情形：於主後1879年12月24日建立第一所禮拜堂(這地點今已無可考究)，據說，這所教會不准建立在鎮內，只准建立在八張碼頭附近的街道上（當時這裡是三峽鎮郊區，是渡船碼頭，是次等宅區的花街柳巷）。不知何時遷建第二所禮拜堂於鎮內（今日民權街128號），這所禮拜堂很可能於日本據台初期，遭遇三千人口的三峽住民之頑抗，以至損失千名日兵，始得控制三峽，在憤怒之情況下放火燒?美麗的三峽街，禮拜堂也可能同時被燒?。據已故林會長老說，馬偕牧師向日本政府請求補償教會的損失，始於主後1900年元月16日派員協助三峽建堂。是為第三所禮拜堂(今日民權街178號)，該堂何時竣工不得而知。

　　2.信仰的黃金時期：從這所禮拜堂完工以後，傳道者才能安定居住傳福音，首位入駐三峽者，就是陳和牧師，他於1901年任三角湧傳道師，於1914年5月5日在三角湧封立為牧師，直到1920年向中會提出辭呈，獲准退休，此後他任三峽教會長老直到1938年才移居台北。自他以降，經歷陳來成、郭貞、陳榮宗、李滾泉、陳旺、駱先春至袁鄒富來等傳道人之任內，可謂三峽教會的黃金時期。這段期間，信徒與地方社會均建立了良好的關係。也使教會邁入寥寥幾所獨立聘牧的教會之一，設立許多佈道據點，是充滿見證的教會。

　　建堂情形：這段期間教會發展到坐無虛席，人數增加一片和睦景象，激起了建堂熱潮。先後於1921年李滾泉任內，林有能傳道之提倡，及1924年陳榮宗傳道任內，石安慎傳道之鼓勵，於1927年長老教會決議進行建堂募捐，於1938年購建堂用地。正大力推展建堂事工之時，奈何時事之誤，帶給三峽教會極大的不幸，不只在建堂上因七七事變之故而寸步離行，更因本堂的駱先春牧師與陳文贊長老，因馬偕醫院董事會的北大家務事，被指通敵罪名被捕入獄六十六天。在這種外在日本政治及內在教會家事的困擾下，硬體建設只有望天興嘆！至為遺憾。三峽教會就在不平衡的狀況下，隨著所謂台北中會於1952年脫離北部大會，直到1968年始復歸今日的台北中會。但建堂事工終於在1950年新春，由偕叡廉牧師破土落實興建，1952年8月10日移入新堂禮拜。(即今日禮拜堂現址)

　　3.孤獨與守成：自移入新堂禮拜的當年，三峽教會參加了葉金木、卓輝隆為主，召集在東門教會成立之所謂台北中會，宣佈脫離北大以後，直到1968年7月7日復歸台北中會之間，徒勞了十六年有餘，感謝主，於復歸台北中會，隸屬北大與總會之後，教會的腳步踏實了。如今已擁有二千餘萬的儲蓄互助社及社區閱讀中心，面對社區與之對話。更期盼著面對興建中的北二高速公路及建設大學二案之桃戰，能激勵未來的三峽教會，面對地方社區的角色和形象得以確立其福音的目標。這是極待深思的課題。