主後1976年底，新北投附近地區之同信者，為建設教會心切，蒙陳萬生長老提供自66年1月16日起假其所設「萬生家庭教會」聚會，該第一次崇拜周炎山傳道證道，計有成人及童六十五人參加。剛好此時許濬明先生自美國深造返台，經聘請為開拓之駐堂傳教師，由此主日崇拜外，並組織主日學、青少年團契、聖歌隊及進行探訪工作，至66年7月將教會定名為「萬生基督長老教會」。又自66年1月起週日清早在教會，週間每晚輪流在會友家庭舉行祈禱會，由於人人建設教會心志堅定且火熱，每晚聚會都很盛況，一直持續二十個月後才按教會一般程序聚會。68年由於教會日益發展，經會友及其他同道者捐獻購置現在房屋做聖殿，並將教會更名為「新北投基督長老教會」，成立女宣會及完成財團法人登記。

　　民國71年4月許濬明先生離職全家赴美國，經聘請戴伯福牧師來堂會牧會，七十二年間購置文士閣溫泉大廈內一戶做牧師館。73年8月底戴伯福牧師為海外宣道工作離職，教會事工囑託台灣神學院陳嘉式教授領導，陳教授於74年7月赴英國再深造，教會事工囑託台灣神學院吳文雄牧師領導，吳牧師並推動成立家庭關懷小組，以利教會成長。

　　本教會開設後曾申請加入台灣基督長老教會台北中會，復於74年間再提出申請，75年8月中會派員蒞會接洽結果，本教會已成立財團法人，並有自治堂會之資格，提經中委會接納准予加入中會，又75年10月12日蒙台北中會派員蒞會主持歸屬禮拜，使本教會成為台北中會內之一個堂會，11月23日中會派員蒞會主持監選駐堂牧師結果，全數選出林欽烺牧師，76年1月11日承蒙中會派特會主持本堂首任牧師林欽烺牧師之就任典禮及慶祝設教十週年紀念，同頌主恩。

　　林欽烺牧師在本堂牧會三年後離職，民國80年8月起至81年7日止，本堂聘任郭昭南先生擔任傳道工作，繼續推動會事。