1964年8月9日,在新竹市內原有東門教會與南門教會,因受外國宣教師把信徒帶走另設兩間改革宗長老教會(原來聲稱不設教會,要協助東門與南門教會事工等等),而剩留下來的信徒不多,舉行聯合禮拜,由吳天賜牧師等促成召開臨時和會決議合併成立取名為中正教會。
1964年9月6日中會議長鄭連坤牧師主持中正教會成立禮拜(地點於中正路38號)。於9月26日召開第一次和會選舉牧師,並接納原有兩間教會長執為現任長執。10月25日首任牧師莊聲茂就任典禮。
1965年12月12日教會遷移至民族路30號(現址),信徒同心努力自購房屋,一楝兩層樓。1973年7月11向國有財局購買教會土地(面積00117平方公尺)。1977年7月3日成立教會建堂委員會,1979年7月15日購買牧師館土地(面積00094平方公尺),1981年8月興建現在牧師館(一棟三層樓房)。1982年4月8日修繕禮拜堂,裝飾內部設備、電化器化、冷氣業。1954年4月設備基督教教育教室等,目前期待購地建堂,求主帶領安排預備,以便實施推展各種事工,榮神益人之願望。