大甲位置在南北部教會的交界，1909年南北教會派代表在彰化協商傳教之界，結果以台灣西岸自大甲溪口至校栗埔直入東為界線，因此大甲教會歸屬於北部教會的最南端，也是北部初期設時最不被重視之真空地帶。

　　當偕叡理牧師與南部宣教師從淡水登陸是1872年3月9日，後來他們一行南下經中壢、新竹，途中李麻牧師患虐疾就以轎代步，於3月14日抵達進大甲城(被記為污穢的城鎮大甲)，又穿過鄉林低地，走入大社（英國長老教會之傳道區）此為教會史最初的記錄。

　　後來北部教會以淡水為基地傳教到台北、宜蘭和新竹等地區，而經過了四十餘年之後才向大甲地區宣教。雖然1910年正式劃入北部教會管轄，但大甲教會與中部附近保持至好友誼。

　　當初有住大甲馬鳴埔一位陳其祥之漢學家，從他傭人旭仔得到基督教的福音頗受感動，經人介紹前往三義訪問鍾阿妹傳道，談論道理更得確信，並邀請他前來大甲設教傳道。

　　1909年7月14日鍾阿妹傳道離開三義，正式受派任大甲設教傳道，於7月27日得苗栗廳准許正式設立佈道所。翌年4月3日宣教師約美坦前來本會舉行第一次施洗，有陳其祥父子與林其藻外十三人受洗為初結的果子。1912年成立堂會，第一任小會議長為宣教師吳威廉。同年8月2日設立首任長老陳其祥、林其藻，執事陳山林、許添火和朱日。1914年9月經濟獨立，於1918年6月16日聘張金波牧師為本教會首任牧師，並成為自治堂會。

　　本會教育培養人才送出教會界者，有陳瓊瑤、陳瓊琚、陳瓊玖、林再添、王守勇、楊彰、林樹、鄭連坤、郭源輝、陳復生、鄭連德、鄭連明、陳永生、莊經顯、陳希信、莊欽展、劉義男和李宗正等，貢獻台灣傳教頗得光彩。此外積極向外宣教，前後開設苑裡(1912年)、通霄(1918年)、中庄(1920年)、日南(1920年)、後龍(1937年)。

　　初期信徒愛主心切，設教翌年1910年得本地望族王厝樂奉獻土地三百多坪(該地係池塘)，信徒獻工填平，建堂中遭遇颱風受損未灰心，終於1912年完成長五丈寬三丈，可容五百人之磚造教堂，又在1934年適逢大甲街市區改正，教堂率先拆除，於1935年蒙王大猶長老獨資奉獻現今之五層塔聖殿，又在1936年添建木造二樓牧師館，1958年承蒙本地出身，日本華僑黃萬居先生奉獻建拾餘坪，1906年將木造宿舍為鋼筋混泥二樓牧師館，1976年增蓋牧師館為三樓。1983年將教堂之木造窗門改為古鋼色鋁質雙層隔音窗並裝設兩部冷氣機，裝潢防止街市之澡音為現代化。

       2015年10月18日下午三點，舉行洪英俊牧師就任第十四任駐堂牧師授職與就任感恩禮拜。。

　　本會得蒙歷代傳教師之牧養與歷任長老執事的協助，會務教勢逐漸進展至今，願一切榮光歸主。