主後1923年得梅鑒霧牧師及林學恭牧師來二林地區佈道,1924年5月16日經丈八斗教會(原斗教會)、沙山教會(芳苑教會)、大城教會等聯合任職會議決,設立臨時佈道所於二林,並得到當時信徒蔡章興先生(稍後任職長老),以其店面無租金提供作為臨時會所,同年7月8日由傳道局派許水靈先生來二林工作,而7月20日正式開設為佈道所,其後由蔡章興、洪卯、謝瑞等奉獻土地,並得到南部大會台灣基督長老教會財團法人提供1782元而建立堂會。
1939年4月聘紀明申牧師為第一任牧師,在其任內於1950年將舊禮拜堂重新改建,以及開設幼葉托兒所。1953年10月聘第二任牧師賴仁聲牧師任內頗多建樹,於1955年10月被推選為P.K.U.(位加運動)執行幹事而離任。1956年~1974年由第三任牧師孫鴻沂牧師接任,前後18年,帶動二林教會對社會服務工作的關懷,並提供二林基督教醫院大部份土地,同時創立「多加儲蓄互助社」。1974年8月聘現在姚文德牧師為第四任牧師,教勢顯著增長,又鑑於原有禮拜堂不敷使用,遂於1976年拆除擴建,於隔年2月23日舉行聖殿奉獻禮拜。其後又於1978年興建幼稚園、電化教室及游泳池,1984年興建完成教育大樓,於同年10月25日舉行設教60週年暨新建設教育館奉獻感恩禮拜。1993年與彰化基督教醫院及二林小區聯合創辦”松年大學二林分校”迄今。二林教會經歷許多傳教者、長執、信徒們苦心經營,並得聖靈同工,原將一切成果歸榮耀上帝。