本教會之緣起，肇始於1938年3月12日由廖得牧師、彭清約長老、林程長老等人招聚信徒，開始家庭式聚會，成立了前金佈道所；後因聚會人數倍增，所以聚會地點變遷，於1941年向高雄中會申請升格為堂會，是為苓雅聚會所，同年5月25日舉行首次聖餐典禮，陪餐者共50名。
1942年李幫助長老自大陸返台，兼任本教會傳道事工，次年日本在台總督府因戰爭危急，嚴禁一切集會，故教會被迫停止活動。1945年戰爭結束，同年10月7日信徒們借用林啟三先生的客廳聚會，第一次守聖餐時請廖得牧師主持，陪餐者27名。
自從李幫助傳道主領每週聚會講道後，教會大大復興，於是另租鄰近青年二路的六嬸仔店面為聚會場所，仍名為苓雅聚會所。教勢大興，會友人數激增，場地不敷所需，遂決定另行購地建新教堂，承蒙楊金虎先生、彭清靠先生、林啟三先生之協助，順利承購現址，1946年5月5日由當時任高雄中會議長林照牧師指導成立前金教會，同年8月15日聘請高金聲牧師主持奠基儀式，11月24日聖殿竣工啟用，設立首任長執，計長老三名，執事四名。1950年3月29日李幫助傳道封立為本會第一任牧師，也是台灣基督長老教會第一位女牧師，因著李幫助牧師的委身，信徒人數激增。乃於1952年11月30日分設小港支會，是為現今之小港教會。
1954年李牧師為開辦道生聖經書院而辭職，同年2月19日聘請阮德輝牧師接任傳道事工，阮牧師善講道、勤探訪，教會座無虛席，自1955年5月5日續分設前鎮支會，現為前鎮教會，1960年5月1日分設中洲仔支會，後來併入旗後教會。為迎接更大的復興來臨，會友心中火熱，1970年1月11日信徒大會通過重建教堂，1971年2月3日動工，在教會建造期間，1971年8月15日，由本會西甲區成人會員56名、小兒會員51名，協助成立中山教會，又於次年3月5日又分協助三多教會，同年4月30日本教會聖殿完工，新建主堂取金字形，狀似合掌祈禱，傍以鐘樓聳立，壯觀肅穆。
1976年11月20日，阮牧師於任內蒙主恩召，由副牧王宗雄牧師接任。王牧師認真探訪，關心會友生活，因生涯規劃，1987年4月離職。
1988年2月陳主常牧師到任後，認真講道，勤於探訪，會友彼此相愛和睦。宣教之心再起，為因應社會的變遷，以及教會設備與場所的更新，因此在1998年3月於原金字形教堂旁建宣教大樓，原禮拜堂則重新整修裝潢，次年12月完工，2000年10月8日舉行獻堂感恩禮拜。
2001年4月開設華語禮拜，俾向廣大的青年學子傳講福音，因聚會人數增多，後移至三樓生活廣場迄今。
2010年2月陳主常牧師盡程退休，聘黃明宗牧師接任主任牧師，綜理教會一切的事工，於2012年1月將青少契聚會改為青年禮拜。
