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本教會創設的發起人為本省初代傳教師高長之四男高再祝醫師與夫人高許美女士於岡山極力傳福首引人歸主，最初信徒有春來長老(土庫人)，許山知先生(林頭人)，李墨先生(澎湖人)等人。首先他們在阿公店(即現在岡山)同心協力，宣揚福音，後來就在黃旺(當時阿公店區長)自宅對面，租番仔之家為禮拜堂。
一九一一年，第一代傳教者張有義傳道師赴任後，教勢頗有進展，又承楠梓教會的援助，遂於當年正式成立楠梓教會阿公店支會。一九一二年為容納日增的信徒，建造了簡陋的竹造禮堂，其後教勢發展甚速，於一九二一年一月廿四日正式升格為堂會。
一九五六年周燕全牧師任內，特別注重對外佈道工作，同年八月底分設燕巢教會，一九五七年一月分設永安教會同年十二月又分設彌陀教會，並同時籌備分設領拔教會。一九六四年許文將牧師任內修建禮拜堂。一九六九年後溫惠雄牧師任期中興建教育館，又重新裝璜現有的隔音設備及裝設,冷氣的禮拜。
一九八一年二月現任傳教師李不易牧師赴任，致力教會增長工作、門徒訓練，教育培育，遍傳福音教勢日進，於一九九一年三月建築完成一間容納四千人的禮拜堂。
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