孫理蓮教會位於花蓮縣新城鄉嘉里村。嘉里這地，別稱「卡來萬」，或作「加禮灣」，即今花蓮機場出入境口附近。現在教會地點原是基督教芥菜種會媬姆學校附設之禮拜堂。
日據時代，加禮灣即設有教會。吳陶、劉文慶、吳德山等牧者都曾在加禮灣教會服事。馬偕博士亦兩度前來造訪。遺憾的是，由於二次世界大戰爆發，牧長、信徒因逃避戰亂而離散。大戰結束後，教會用地由國民政府接收，作為興建眷村之用。幸有柏老允姊妹（長老）提供住宅作為信徒聚會之場所。當時，信徒不孫理蓮教會（舊稱嘉里教會）分族群共聚一堂，敬拜上帝。柏老允長老去世後，教會缺乏領導者，協同會牧者在此時期介
入，加禮灣教會因而歸屬協同會。不過，許多阿美族信徒四散而去。
1954 年，阿美族信徒再次聚集。這期間，東部中會江天順牧師和黃慶豐牧師前來協助。然而，教會一直缺乏專職牧者，信徒在靈性的成長方面陷入困境。芥菜種會孫理蓮女士在得知情況後，支助並差派潘阿妹傳道前來協助。時間長達7 年。後來，教會禮拜堂受颱風侵襲，損害嚴重，不堪使用，信徒再次流離四散。
1983 年12 月17 日，阿美中會北埔、中美教會長執，和本地區信徒，在李阿隆住宅聚集商討，決定在本地區正式成立「嘉里佈道所」，開拓福音事工。中會幹事曾文治牧師亦列席指導，並致函芥菜種會，商借該會舊禮拜堂作為本教會聚會所。1984 年1 月18 日，由陳金成牧師主持選舉，首屆長老計施儒雅、張秋生、趙古金、許金榮、林坤成等五名。執事計有林成義、張阿昌、林阿昌、張美雲、李阿隆等五名當選，他們成為本教會拓展事工的中樞。
1984 年12 月慶祝聖誕節時，教會已有50多位信徒。
