日據時代，日本政府嚴禁基督教會將福音傳入原住民部落，當時太昌部落僅有六戶居民，承租公有地種植雜糧。約1945 年間，本教會故長老鍾阿成先生，在工作之餘認識了當時正在傳揚福音的水源村村民Ckiisay Pisaw，很自然地接受了福音。之後，他積極的把福音傳給自己的族人，得到蔡成榮、林阿生、田阿色等家族的認同與支持，並共同負擔傳揚福音之重任。當時，鄰近的水源教會聽到有此重大成果，莫不感到非常興奮。Wilang ( 高添旺牧師) 義不容辭的肩負起傳揚福音給太昌部落的重責大任，不分晝夜、不畏艱難，直到全村村民歸順真理。
起初，太昌部落並無固定之聚會處所，每逢主日禮拜，信徒即徒步至水源教會與該教會信徒一起作禮拜，持續約有半年餘時間，後因言語之障礙，造成溝通不良，只好在自己部落裡覓聚會之處所。在主的引領下，找到林阿生現住宅址做為聚會處所。當時，水源教會的信徒在Wilang ( 高添旺牧師) 帶領之下，載了一卡車的桂竹前來，並協助太昌部落之信徒建造禮拜堂。從此，太昌部落便有了屬於自己作禮拜的地方。另外一方面，當時在花蓮港教會牧會的吳天賜牧師，由聖經學園的陳志豐牧師陪同到太昌教會傳福音，並協助母語翻譯，在母語的證道之下，各信徒之信仰更加成長、更加堅定，有數位弟兄姊妹毅然決然的前往花蓮港教會受洗。
約在1946 年9 月6 日前後期間，信徒人數急遽增加，使得原教堂無法容納眾多的信徒來聚會，為尋覓更寬敞的地點重建教堂，於是選在鍾阿成宅第旁的族人聚會所（即現今的活動中心）集會。當時的頭目余進源、林阿生兩位先生是日本退役軍人，在他們合作之下，拿著木製的十字架，共同插在聚會所之屋頂上，
從此該聚會所成了部落敬拜神之中心。不幸的是，當時花蓮發生了大地震，將聚會所夷為平地，信徒又再次尋覓適當地點的重建教堂，最後在現今教會會址蓋茅草屋作為禮拜聚會之所， 並於1948 年5 月20 日獻堂， 感謝主。
余進源頭目與林阿生先生不忘自己族人需要得救，開始鼓勵族裡年青人參加聚會，並到鄰近之南華、田埔、池南等部落傳揚福音，在他們的努力之下，終於在部落年輕人當中出現了兩位有為的青年－黃慶豐牧師和李金堂宣教師，
他們為終生事奉主與傳揚福音，毅然決定就讀美崙聖經學院（玉山神學院前身）學習神學。
李金堂宣教師在該學院畢業後就被派到本教會牧會，遺憾的是，當時天主教亦來本部落傳福音，並且以救濟物品為利誘，致使本教會之數位信徒改宗到天主教作禮拜。更不幸的是，當時用茅草建造的禮拜堂也因大颱風侵襲而倒塌。但這樣的情況並沒有把所有信徒信仰、信心吹垮，反而更激發信徒們的決心和毅力，同心協力製作空心磚，一石一磚的在原址逐層建造，並以鐵皮為屋頂，完成了禮拜聚會處所。在此之後，就陸陸續續有許多傳道人，如：曾四郎、吳建豐、柯柏拜、葉德生、張明佑、林東益、陳文相，與蘇金榮等來本教會牧會，使得本教會更加成長茁壯。
自1946 年9 月6 日至1987 年7 月16 日止，本教會禮拜堂已歷經41 年之久，教堂老舊不堪且部分設施損壞，加上一下大雨就會漏雨，為此，當時之蘇金榮牧師就提議建造一棟符含現代化功能的禮拜堂，並經和會一致通過，信徒們就同心積極的籌劃重建教堂事宜。從開工至竣工，歷經四個寒暑，總工程費達新台幣1,902,356 元，感謝神！宏偉的教堂於1990 年1 月14 日建造完成，阿美中會中會議長顏約翰牧師親臨祝福啟門獻堂。
1997 年3 月間，蘇金榮牧師積勞成疾，於任內病逝，在無傳道人牧會期間，本教會長老執事及信徒，不但不因此而懷憂喪志，放棄信仰，反而更加地堅定信心與信仰。是年8 月6 日，本教會聘請陳志豐傳道師來本堂牧會，繼續主的事工。1998 年初，本教會和會決議，將原一樓的牧師館改為教育館，三樓增建牧師館，同年8 月中旬，阿美中會第37 屆春季會議，通過將太昌教會更名為美雅麥教會，同年11 月14 日陳志豐教師封立為牧師暨新建牧師館落成啟用典禮。 2001 年 9 月6 日慶祝設教55 周年，恭請中會副議長潘清誠牧師蒞臨證道，陳志豐牧師2008 年12 月恢復原住民姓名為希僕文•幸蓋。2010 年9 月小會推薦希僕文競選中會總幹事，且獲得支持，當選總幹事。2011 年1 月16 日結束美雅麥任期。
2013年1月13日若海．阿安沐傳道師封立牧師暨就任授職於本會。
感謝主恩，本會硬體設備均已建造完成，未來將邁入新的里程碑，期許加強各團契的組織功能與信仰造就，使教勢成長興旺。
