1947年的夏季，石磊部落的一個居民名叫徐田，為了參加尖石鄉一年一次的鄉運，提早到前山梅花部落的親戚家過夜，當天晚上參加了部落的一個聚會，這個聚會是在傳講從來沒有聽過的事，因此福音的種子就這樣進入在這一位居民的心中。本村福音開始進入，1948年6月從花蓮聖經學校(玉山神學院的前身)畢業的葉廷昌牧師、賴

民道牧師、葉錦泉牧師，回鄉之後就開始在尖石的前後山傳福音。

　　玉峰村是由葉廷昌牧師負責巡迴佈道。首先是向宇老部落佈道，後來不斷向玉峰、石磊傳福音。到了石磊部落傳福音的時候，因徐田先生曾經聽過這樣的福音，就很容易信主，因此也開始有許多的人受洗歸主。福音就這樣開始進入石磊這個部落了。由於葉牧師在巡迴佈道中工作繁重，把石磊和玉峰這個地區的福音工作，交由徐田和黃文明兩位初信者。信主的人漸漸多，也開始找尋聚會的場所，誰家的空間大就在那裏聚會，過著十年游牧式的聚會，至到1958年在石磊國小旁的空地建了一座用竹子建造的教堂，這是石磊教會的第一間教會，並命名為”台灣基督長老石磊教會”。

　　由於信徒快速的增長，信徒重新尋找土地來建比較大的教堂，就在主後1970年由江添典先生奉獻土地讓教會來建堂，也就是在教堂的所在地。會友決議建一座用混凝土的教堂，完全用人工的方式建造起來，並在1971年獻堂。而後在主後1973年加建第二層並在次年獻堂。1980年建造牧師館。