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早在60年代起，已有從力行村及發祥村的族人因著子女的教育而到埔里鎮租房子或寄居親戚家。當時伯特利女子聖經書院因著宣教之故而在鎮上暫設山地聚會所(埔里長老教會邊平房)，它雖不是力發教會的前身，多少是有啟發的影嚮，終究也對一些信徒與青少年的靈命與教會觀有正面的幫助。直到70年代後，更多的族人為了子女、家計與工作，以?定並提高生活的水準而到埔里居住，甚至購屋定居。
吳善寬牧師未離任新望洋教會前已看見埔里鎮需要一間場所提供從力行村(力行、翠巒、溫泉)與發祥村(瑞岩、紅香、梅村)下山的信徒，以繼續培育他們的靈命。因此在1987年間離開新望洋教會後就開始策劃、探訪、聯絡要在埔里鎮上開拓一間教會取名叫「力發教會」，起初的構想只是為召聚從力行與發祥村來的信徒一起禮拜並繼續培育他們的靈命。1988年開始聚集原住民的信徒來禮拜時，參加者不只是力行發祥村的泰雅爾族信徒，連太魯閣族(現改為賽德克族)與布農族也來禮拜，因此信徒人數曾達到60-70位。1989年11月正式設立「力發佈道所」後不久，由於語言不一，隨後陸續成立「埔太教會」與「埔農教會」。
1988年-1998年間，力發教會信徒的流動性雖大：時多時少，甚至搬遷四次的聚會場所，但因著對上帝的信心，不只?定信徒，其間也開拓了鄰近的「眉原教會」。之後，上帝也透過賴貫一牧師的關懷與協助而到謝緯松年營地聚會。
1998年4月高清賢牧師派任力發教會(支會，1999年2月昇格堂會並聘高牧師為第一任牧師)。高牧師牧養的四年當中，雖經歷921大地震，仍積極裁培青少年的靈命及推動青少年的關懷事工而成立了「力發教會原住民學生中心」；同時開始尋地及購屋計劃，雖未完成，卻匯集一股「建堂」的基石與動力。
2002年9月 張保羅牧師聘任為第二任牧師，在善盡其專長與努力帶領信徒下，再由謝緯松年營地搬遷至台灣地理中心碑附近租屋作為禮拜堂與安親班的場所。更因著上帝的恩典，在2006年9月30日於現址完成購買/整建並啟用的永久禮拜堂。不僅在宣道上向原住民牧養傳福音，也藉社區的宣教撒下福音的種子，並且在天災頻繁的泰雅爾部落中，可作為總中會救/賑災之據點。
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