金包里教會設立至今已122年歷史(1879-2001)。是由馬偕博士和林孽於1879年4月28日,在金包里(金山舊名)的社寮所開設的。在幾年後因中法戰爭禮拜堂受損,及至馬偕牧師別世後25年間,本會沒有再建堂的記錄,福音事工也因而停頓。
及至1916年宣教師劉忠堅及基隆教會熱心會友再次前來本地佈道,隔年1917年才重開佈道所,並成立為基隆教會支會,名為台灣北部基督長老教會金包里講義所。1933年在會友共同努力下購得現址並建堂。
1969年謝皆明傳道至本會牧會六年,帶起本會一波的大復興,至今仍深獲感念。
1977年本會將原有破舊禮拜改建為二樓鋼筋混凝土結構的聖殿。
1978年鄂主成傳道赴任後,舉行獻堂感恩禮拜並計劃努力邁向成立自治堂會的目標。
隔年1979年本會即升格為堂會,並舉行本會設百週年暨升格堂會感恩禮拜。
再隔年1980年鄂主成牧師封立並就任本會第一任牧師。此時期實為本會歷史之重要里程碑。
1982年黃勇男教師封立並就任本會第二任牧師。
1984年以後十幾年間皆由畢業傳道及神學生牧會的型態。在此間本會亦曾因故暫停聚會,財產移交北大。隨後再經萬宏杰傳道及戴乃臣傳道的努力,重新恢復堂會及宣教活力。
1997年李豐盛傳道畢業後受派至本會牧會,並於1999年封牧並就任本會第三任牧師。又於此年感恩節時舉行本會設教120週年感恩禮拜,邁向新世紀宣教使命。
在這122年來,曾在本會牧會的傳道人共27位,牧師第三任。在這當中雖有風雨,但上帝仍保守帶領。願上帝更恩待,更復興金包里教會。