本會創立於主後1994年11月20日。由母會台南中會民族路教會出於教會拓展異象積極籌設分會的成果。

本會設址在台南市永康區中華路703巷17號，為四樓透天建築，左右各緊鄰其他住戶，環境空間為一深長型的住屋，每一樓坪數約40坪，四層樓共計約160坪。當時的購置款，加上裝潢、設備、以及其他費用，總計約1600萬元，全部費用由母會民族路教會負擔 (其中包括母會所撥林東漢長老220萬的「宣教基金」，及母會一位會員吳金鳳姊妹所捐獻330萬元的「開拓基金」)。

本會創立之初，由民族路母會支援成立佈道所，當時由台南神學院神學生馮偉晉先生及數位熱心的母會同工協助草創時期的各項事工，為期一年之久。之後母會聘田永人傳道負責本會牧會工作及會務。不久本會升格為支會，田永人傳道也於1997年封牧，成為民族路教會派駐本會的牧師。

2002年7月田牧師離任後，本會有二年之久沒有專責牧者，幸得母會的支援，暫由洪溫柔牧師及王受祿傳道發落牧養傳道的工作。另外亦有台南神學院神 學生魏敏男先生協助部份教會庶務。長執會也在其中負責一切會務之計劃、執行，及各項事工之推展，使得教會運作一切穩定、正常。

2004年7月本會正式在台南中會秋季議會通過升格為堂會，並於8月1日起，由中會派任黃淑雯傳道為本會駐堂傳道師，銓派楊恆銘牧師為本會小會議長。

2007年1月台南中會春季議會中，黃淑雯傳道師正式取得牧師資格，於同年6月10日按立為牧師，並成為本會升格為堂會以來第一任牧師。