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大約1931年左右，姬望女士把神的話，帶到德魯固族的村莊，之後；福音也隨之傳到三棧部落。當時為日據時代，日本為統治方便，強力禁止部落居民相信耶穌基督的信息，因為日本政府認為基督教是美國的宗教，可是德魯固族渴慕耶穌基督的福音，信主的人不畏懼，仍然暗暗的秘密聚會。
1945年世界大戰結束，基督徒可以自由的信仰耶穌基督。德魯固族傳教姬望、周玉葉、羅梅花、高天旺、劉富昌等，相繼來到三棧部落傳耶穌基督的福音。本會會友因聖霝的感動就在林榮喜(Loking-Boxil)的舊宅禮拜，時為中心交戰期，局勢混亂，覓得臨時聚會處非常不易，當時(Loking-Boxil)憑信心提供聚會之處（只是借用舊宅作禮拜之用途）。1950年初因會友越來越多信主，Loking-Boxil的舊宅不足使用，周永昌(Pihang)同意當時的囑託傳道王永發(Lihang)，經游德(Karaw-Dangaw)、游德行(Tosong-Dangaw)、李義成(Paysang)請求，在周永昌(Pihang)的地方，會友合力以木造屋來建造教堂正式為三棧佈道所。
1950年底本會從十一鄰的地方遷移到新地方（即現教堂會址），因金福助(Loking-Hagay)信徒信仰堅定，正式公開在神與眾人面前奉獻 地，全體無不感謝上帝的預備，也謝謝金福助(Loking-Hagay)的奉獻。信徒得到非常大的信仰鼓舞，決議建造半水泥，屋頂瓦礫的教堂。1989年11月12日，經過本會信徒大會決議；委託建設委員及李季生牧師的努力，全體信徒奉獻及台灣教會的關懷，終於新建完成美倫美奐的現代建築物（這就是現在的教堂）。
1994年5月初教會左側土地懸案，經由李孝誠牧師及長執多方的協調終將土地完全解決。2000年9月初本會申請政府，並經鄉公所土地審查認定為台灣基督長老教會財團法人無償使用地。
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