淡水教會是馬偕博士親手設立之教會，堪稱北台第一聖會，前人建蓋淡水禮拜堂時亦曾考慮過此一要素。

教堂所在之地昔稱「龍目井」，因有雙井比鄰而得名，當年馬偕在此租屋及購屋建堂之地皮，均為地主陳阿順所有。

在一八九○年以前，淡水教會皆在附近租屋，之後才在教堂今址改建第一所教堂。此教堂並無近照但從風景照看來，其風格與馬偕生前所設計之教堂極為相似，該教堂目前僅存基座，古井及那部明治時代之古琴（存於今日教堂內）。

爾後，因教堂老舊不堪使用，遂在一九一五年二度改建。於五月的第二禮拜開工，當時造價為一三九○元，內長四丈寬五丈（約五十五坪），大樑九寸半徑，由吳威廉牧師督工。教堂因磚造外飾白灰而被暱稱「白色禮拜堂」。此教堂使用之大鐘今日尚存，部份座椅亦仍在使用中，至於講台桌椅則已在六○年代贈予小基隆教會。

這所禮拜堂到一九二八年便已容納不下全部信眾，由於當時淡水中學和神學院師生都來此禮拜，並且為了紀念設教六○週年，因此決定重建並開始進行籌畫。建築經費除會友、學生奉獻外，大部份由偕叡廉長老向加拿大母會申請補助。於一九三一年開工，由二世馬偕偕叡廉長老親自設計督工，一九三三年九月完工，11月28日落成使用，是為了紀念馬偕博士來台六十週年，又稱「設教六十禧年禮拜堂」。

這棟仿歌德式教堂，由著名洋樓匠師黃阿樹（人稱「樹司」）承蓋，三萬塊品質極佳的「黃東茂」磚，以精細的磚工砌出變化有序的壁面。內部以11.6公尺大跨距鐵骨托住屋頂。最大特色乃是左邊之鐘塔直插天際宛若禱告的手，配合著淡水旖旎風光，遂成了名聞全台的風景線，一直是畫家們最愛的寫生題材。

淡水教堂六十餘年來始終保持原貌，內部之座椅、講台、聖桌尚在使用。一九八六年教堂因台灣瓦難以維修，而翻換瑞典進口之鋁質浪板，，並且更替破損殆盡的彩色玻璃，特別是正面和鐘樓的五扇窗戶之圖案，更為這座美麗的教堂憑添典雅別緻之風情，更為這座美麗的教堂憑添典雅別緻之風情，成為淡水的名勝。

今日這座教堂仍是淡水最大之教會，每禮拜天都有三百人以上在此作禮拜，禮拜堂的二樓是佔地92坪的禮拜大廳，後面木質閣樓原是聖歌隊席位。一樓是28坪的副堂和行政辦公室。

(文字內容取自：淡水教會網站)