木柵基督長老教會位於木柵村中心，木柵山的山腳下，西隔二層行溪與長寮埔相對，北鄰九芎橋。

木柵教會建於咸豐年間，在清同治七年（西元一八六八年）十二月六日竣工，為全國第三古老的基督教堂，是羅漢門最早的基督教會，也是羅漢門的基督教中心。

木柵教會的由來，是由木柵居民戴返先生夫人，罹病前往旗后（高雄市旗津），就醫於馬雅各醫師，住院期間，得聞主的福音，喜獲得救的真道，悔改信主耶穌基督，病癒返家後，有感主恩浩瀚，領導人心歸主心切，即向親屬鄰里為作美好見證，夫婦同心協力宣導，幸獲聖靈默助，達得姬蜜、池東淵、陳清山、劉弄、鄂宦、姬文美等十數戶，陸續歸依主道。時載翁便提供自宅充為臨時禮拜堂之用，後有英國宣教士『巴克禮牧師』等人巡培養信徒信仰並廣傳福音，教友增加、信徒集議，大家鳩資，決議建堂，購地興建土角造禮拜堂，於主後西元一八六八年十二月六日興建會堂於現址。台灣光復後，當時舊禮拜堂因為是土角建造，年代甚久，其已頹舊，於主後西元一九九六年十一月十九日舉行奠基典禮，於主後西元一九七0年十二月十六日重建完成。暨適逢慶祝本會設教一百週年紀念大典之時，以此新建呈獻上帝的獻禮。

又於主後西元一九七八年九月四日開工籌建教育館，一九七九年四月十五日完工，適逢本會設教一一0週年紀念，遂於一九七九年聖誕節將此會館做為慶祝紀念的獻禮。本會曾分設台南縣左鎮岡林等及本鄉永興村等教會。

文章及圖片來源：國立台南社會教育館http://www.tncsec.gov.tw/