一九Ｏ一年二月牛挑灣教會黃烏皮長老至鹽水傳道，起初信主的有呂會(曾徽長老令外祖母)、方氏(黃朝碧先生之祖母)、楊羌(楊世謀之父)、楊潔、李太太(李榮裕執事令祖父)，在後厝仔租李添兄弟的房子作為福音堂開始聚會。三年後，因有呂姓警察反對基督教，在禮拜堂旁建公共廁所，因此於一九Ｏ四年五月遷至現址。當時經費需要四百元，由教士會補助三百元，於一九一八年得台南中會許可成立台灣基督長老教會鹽水教會。

後來，謝石頭執事向新街日本人大島先生購買舊醫生館，改建聖殿，自此教勢大展，信主人數日增，分設教會如下：

1932年分設新營教會和菁寮教會
1950年分設新興教會
1951年分設頂洲教會
1955年分設鐵線橋教會和新港東教會，並設榮光托兒所
1958年分設過路教會及義竹教會
1961年慶祝60週年紀念並建築鐘塔
1963年新建二樓牧師館
1974年奉獻新的聖殿(現在)
1981年新建三樓並有地下室的教育館
1998禮拜堂屋頂全部翻新

文章來源：大專事工部
圖片來源：http://cobra.ee.ntu.edu.tw/