主後1928年六甲地區信徒有感於禮拜必須到善化、台南、白河等地，在交通上非常不方便，於是決定在文化街42巷14號（施宅）舉行家庭禮拜──吟詩、讀聖經，這就是六甲教會的前身。

聚會人數愈來愈多，場地已太狹窄，經過商議承租復興街56號（陳宅）為聚會場所。1931年4月1日教會正式成立〔六甲基督長老教會說教所〕。1932年中會正式派傳道師駐任本會。教會為從事幼稚教育以及尋覓傳教者住處，再次遷移至六甲庄5184號。1938年林德修執事欲遷往上海定居，將其所有之房屋及土地以半價賣給教會，全體信徒熱心奉獻購得現址。

1961年3月成立「新建禮拜堂籌備委員會」，4月3日正式開工，期間全體信徒胼手抵足熱心奉獻，始於1962年9月28日舉行獻堂典禮。1963年中會卅三屆春季議會正式升格堂會，教勢日增。1968年信徒再度同心合意興建教育館，6月2日舉行定基式，10月25日竣工。由於教會禮拜堂是磚造，無鐵筋，歷經廿餘年漸呈龜裂，以致成為危險建築物。1985年2月20日定期會員大會中鑑於禮拜堂建築物的危險，議決重建聖殿案，成立「重建禮拜堂籌備委員會」並積極尋覓更寬闊的土地；但因地價的波動，地點的不適宜，決定原地重建。1988年聖誕節舉行定基礎禮拜，1990年2月分別與允詳營造公司，洛辰企業有限公司（水電）簽定合約興建禮拜堂。3月18日開始動工，歷過一年餘，終於完成地下一樓，地上四樓的禮拜堂建築物。並於1991年6月17日舉行設教60週年暨聖殿重建感恩禮拜。

文章及圖片來源：台南中會http://tainan.pct.org.tw/index.htm